admin 管理员组

文章数量: 887016

生信环境搭建

WSL2与Miniconda3

  • 生信环境搭建
  • 前言
  • 一、下载WSL2
  • 二、安装Miniconda3
  • 三、安装Anaconda
  • 总结

前言

生物信息学需要处理大量数据，然而在Windows系统下有些操作显得尤为复杂。例如，从NCBI中下载大量序列文件，在Windows系统下可能需要一个接着一个的下载（也许可以用爬虫爬取），这样就过于浪费时间。Linux系统下进行批量下载尤为容易

对于Windows用户，进行Linux系统的操作有三种选择，第一是Linux子系统WSL2；第二是虚拟机，例如VM；第三是双系统；这里推荐Linux子系统。

WSL全称Windows Subsystem for Linux，即Windows下的Linux子系统。

一、下载WSL2

1.首先了解你的电脑版本，找到适用你电脑的wsl版本。
2.你需要打开控制面板

3.打开“程序”

4.选择启用或关闭Windows功能，并打开“适用于Linux的Windows子系统”，最好关机重启一次


5.用管理员身份打开Windows PowerShell输入下列代码：

dism.exe /online /enable-feature /featurename:VirtualMachinePlatform /all /norestart

6.打开Microsoft下载相应的Ubuntu

我第一次下载的是第二个版本，但是老是打不开，显示wsl --shutdown。

下载第一个之后能打开，但是出现了0x800701bc Error: 0x800701bc WSL 2 ???

在网上搜索一番后发现是内核没有升级。可以通过以下链接下载升级文件。然后重启电脑（这里参考了华墨1024写的文章）
下载升级文件地址：https://wslstorestorage.blob.core.windows/wslblob/wsl_update_x64.msi

之后就可以正常使用啦！

如果使用Microsoft store安装ubuntu出错或者下载不了，可以使用管理员身份运行powershell，输入：

wsl --install -d ubuntu


下载终端

二、安装Miniconda3

打开wsl2，输入以下命令：

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

下载完成后，给予权限：

chmod 777 Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

而后运行软件：

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

而后激活conda，如果遇到conda: command not found

原因是~/.bashrc文件没有配置好。

输入

vim ~/.bashrc

然后在最后一行输入,YOUR_NAME是你的用户名

export PATH=$PATH:/home/YOUR_NAME/miniconda3/bin

而后激活miniconda3就可以啦

三、安装Anaconda

anaconda的安装和Miniconda的安装非常相似。
anaconda_Linux64位版本，输入以下命令即可下载

wget https://repo.anaconda/archive/Anaconda3-2021.04-Linux-x86_64.sh

其他版本可以点击这里进行查询

总结

以上就是关于wsl2以及miniconda3的安装啦！如果解决了你的问题可以留下赞再走哦！

本文标签： 准备工作 系统 Windows Anaconda

版权声明：本文标题：windows系统下装载wsl2，安装Miniconda3或Anaconda进行生信准备工作 内容由网友自发贡献，该文观点仅代表作者本人， 转载请联系作者并注明出处：http://www.freenas.com.cn/jishu/1728328496h1229303.html， 本站仅提供信息存储空间服务，不拥有所有权，不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容，一经查实，本站将立刻删除。