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案例分析

问题表现

使用毕昇编译器构建Gromacs，编译选项和链接选项如下：

"-mcpu=tsv110 -O3"

在make构建的过程中遇到的undefined reference问题如下：

/usr/bin/ld: ../../lib/libgromacs_mpi.so.4.0.0: undefined reference to `f90_str_copy_klen'
/usr/bin/ld: ../../lib/libgromacs_mpi.so.4.0.0: undefined reference to `__pd_powi_1'
/usr/bin/ld: ../../lib/libgromacs_mpi.so.4.0.0: undefined reference to `f90_strcmp_klen'
/usr/bin/ld: ../../lib/libgromacs_mpi.so.4.0.0: undefined reference to `__ps_powi_1'

原因分析

首先运行"make -j 1 VERBOSE=1"找到出错的具体命令，大致如下：
mpicxx ... somefile.cpp -lgromacs_mpi
由于libgromacs_mpi.so.4.0.0含有毕昇Fortran编译器构建出来的函数，而mpicxx没有链接对应的库，导致符号找不到。__pd_powi_1是libpgmath.so（在BiSheng 2.3.0之后改为libbsmath.so）的函数，f90_str_copy_klen和f90_strcmp_klen是libflang.so的函数。

解决方案

经过尝试，以下两个方案均可以解决上述问题：

  • 方案1：使用lld链make接器而不是默认的ld链接器，可以在链接时添加选项"-fuse-ld=lld"来指定使用lld链接器
  • 方案2：在使用ld链接器进行链接时，添加链接选项"-lpgmath -lflang"可以解决，即mpicxx ... somefile.cpp -lgromacs_mpi -lpgmath -lflang

补充说明

遇到别的符号找不到可以试试：

libs=`ls /path-to-bisheng-install/lib/*.so -l|awk -F " " '{print $9}'`
for lib in $libs
doobjdump -D $lib |grep f90_strcmp_klenif [ $? -eq 0 ];thenecho "$lib"fi
done

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